Kaggle競(jìng)賽賽題解析：HuBMAP 醫(yī)學(xué)器官分割

Category: 國(guó)際競(jìng)賽 Date: 2022年7月8日上午10:16

如果你問CS領(lǐng)域哪個(gè)學(xué)術(shù)活動(dòng)最出名，大多數(shù)準(zhǔn)留學(xué)生第一反應(yīng)都是想到Kaggle學(xué)術(shù)活動(dòng)。Kaggle是全球頂級(jí)的權(quán)威性數(shù)據(jù)科學(xué)學(xué)術(shù)活動(dòng)平臺(tái)，也是當(dāng)今最大的數(shù)據(jù)科學(xué)家、機(jī)器學(xué)習(xí)開發(fā)者社區(qū)，其行業(yè)地位獨(dú)一無(wú)二。

比賽名稱：HuBMAP + HPA - Hacking the Human Body 分割多器官功能組織單元

比賽鏈接：https://www.kaggle.com/competitions/hubmap-organ-segmentation

比賽類型：計(jì)算機(jī)視覺、語(yǔ)義分割

比賽背景人類生物分子圖譜計(jì)劃(HuBMAP) 正在努力在細(xì)胞水平上創(chuàng)建人類參考圖譜，旨在繪制人類細(xì)胞、組織和器官中的蛋白質(zhì)表達(dá)圖。

在本次比賽中，您將識(shí)別和分割五個(gè)人體器官的功能性組織單位 (FTU)。您將使用組織切片圖像數(shù)據(jù)集構(gòu)建模型，并盡可能準(zhǔn)確地分割 FTU。如果成功，您將有助于加速世界對(duì)細(xì)胞和組織組織之間關(guān)系的理解。

比賽任務(wù)您將使用組織切片圖像數(shù)據(jù)集構(gòu)建模型，并盡可能準(zhǔn)確地分割器官功能組織單元。

Kaggle賽題解析：HuBMAP 醫(yī)學(xué)器官分割

評(píng)價(jià)指標(biāo)使用 Dice coefficient進(jìn)行評(píng)價(jià)，通過(guò)對(duì)比真實(shí)標(biāo)簽與選手提交的預(yù)測(cè)結(jié)果：

數(shù)據(jù)描述訓(xùn)練數(shù)據(jù)集由來(lái)自公共 HPA 數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)組成，公共測(cè)試集是私有 HPA 數(shù)據(jù)和 HuBMAP 數(shù)據(jù)的組合，私有測(cè)試集僅包含 HuBMAP 數(shù)據(jù)。

[train/test].csv：訓(xùn)練/測(cè)試集的元數(shù)據(jù)

[train/test]_images/：訓(xùn)練/測(cè)試集的圖像

train_annotations/：訓(xùn)練集標(biāo)簽

比賽賽程

2022年9月15日：報(bào)名截止日期。您必須在此日期之前接受比賽規(guī)則才能參加比賽。

2022年9月15日：團(tuán)隊(duì)合并截止日期。這是參與者加入或合并團(tuán)隊(duì)的最后一天。

2022年9月22日：最終提交截止日期。

賽題獎(jiǎng)金

1st Place - $15,000

2nd Place - $10,000

3rd Place - $5,000

解題思路賽題是典型的語(yǔ)義分割賽題，需要使用語(yǔ)義分割的模型來(lái)完成。在完成的過(guò)程需要考慮對(duì)圖像進(jìn)行切分，搭建魯邦的模型。