《Science》發(fā)布了人類基因組的第一個(gè)全分辨率遺傳圖譜

基于全基因組序列圖譜，解釋兩種生成人類多樣性的基本機(jī)制是如何工作的。

Amgen公司（生物醫(yī)藥公司）的子公司位于冰島的deCODE遺傳學(xué)的科學(xué)家今天在Science發(fā)布了利用全基因組序列數(shù)據(jù)開發(fā)的第一份人類基因組遺傳圖。

該圖提供了迄今為止最詳細(xì)的有關(guān)人類進(jìn)化的兩個(gè)關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)因素之間的位置、速率和聯(lián)系。

1.重組——卵和精子形成過(guò)程中發(fā)生的基因組重組；

2.從頭突變——我們的每一個(gè)基因組都會(huì)有一些非固有的很小的變異，它們既不來(lái)自爸爸也不來(lái)自媽媽。這兩個(gè)過(guò)程共同保證了每個(gè)人都是我們物種的獨(dú)特版本，但是，從頭突變也是導(dǎo)致人類罕見(jiàn)疾病的主要原因。

這篇《Science》文章利用deCODE的冰島獨(dú)特的群體遺傳學(xué)資源向科學(xué)界提供了最新的遺傳圖譜。他們?cè)?002年發(fā)布了6000個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記，有助于正確組裝第一個(gè)參考基因組。2010年，伴隨著第一臺(tái)商用全基因組測(cè)序儀的推出，deCODE使用了300,000個(gè)標(biāo)記來(lái)創(chuàng)建一個(gè)更詳細(xì)的地圖，以指導(dǎo)這類新數(shù)據(jù)分析。今天的研究利用了15萬(wàn)冰島人的序列數(shù)據(jù)（近一半冰島人口），精確定位了450萬(wàn)個(gè)交叉重組和超過(guò)20萬(wàn)個(gè)從頭突變。

“過(guò)去二十年里，我們致力于研究和出版關(guān)于從頭突變和重組以及人類進(jìn)化和疾病相關(guān)性的研究和出版。我們之所以這樣做，不僅是出于了解我們這個(gè)物種的興趣，還因?yàn)樵诒鶏u，我們有獨(dú)特的資源來(lái)解決與健康和醫(yī)學(xué)有關(guān)的這些問(wèn)題，”deCODE首席執(zhí)行官、論文作者Kari Stefansson說(shuō)。

“進(jìn)化的經(jīng)典前提是，它首先由隨機(jī)的基因變化提供動(dòng)力。但是我們?cè)谶@里詳細(xì)地看到了這個(gè)實(shí)際過(guò)程如何被系統(tǒng)調(diào)節(jié)——基因組本身、重組以及從頭突變聯(lián)系在一起。我們已經(jīng)鑒定了35個(gè)影響重組率和位置的序列變異，并表明重組位點(diǎn)的從頭突變比基因組其他位置的突變可能性高出50倍以上。此外，女性對(duì)重組的貢獻(xiàn)更大，男性對(duì)從頭突變的貢獻(xiàn)更大，而后者是兒童罕見(jiàn)疾病的主要來(lái)源。我們?cè)谶@里看到，在一定范圍內(nèi)，基因組本身是產(chǎn)生多樣性的引擎。這顯然有利于我們物種的成功，但對(duì)一些患有罕見(jiàn)疾病的個(gè)體來(lái)說(shuō)代價(jià)巨大，因此我們必須努力解決這一集體責(zé)任，”Stefansson博士總結(jié)道。